终极蜘蛛侠第二季从2000年开始的新系列。以《神奇蜘蛛侠》为蓝本，重新开始蜘蛛侠的故事。人物设计也与原版不同，更满足21世纪的风格。目前连载至160期，大事件“蜘蛛侠之死”已结束。在160期中绿恶魔与Peter Parker互击而死。此后开始新系列《终极漫画 全新蜘蛛侠》，主角换为一个拉丁混血的少年。