故事开始于墓地，Horatio Caine正在教堂向神父告解，外面传了一阵枪声...虽然破案，但也为季末做了铺垫。 本季加入了CSIer的一些故事，Eric Delko被牵涉到大麻事件中去，遭到了内务部的调查。Ryan Wolfe一次调查中被针子射伤了眼睛，影响了视力。Horatio Caine因为Eric的事情认识了他的姐姐Mari，最后还结为夫妻。而这一季的主线是实验室里出现了内奸，谁是内奸..